The Gators zahájili sezónu 1988 5–0 a byli zařazeni až na č. 14. Během říjnového zápasu proti Memphis State Tigers si hvězdný běžec Emmitt Smith poranil koleno a nemohl měsíc hrát. Florida prohrála soutěž Memphis State a další tři také, přičemž Gatorův přestupek nebyl schopen dosáhnout jediného přistání, zatímco Smith byl odsunut na vedlejší kolej. Trestný čin pod koordinátorkou Lynn Amadee se potýkal s celou sezónou, když Gator quarterbacks kombinoval hod tři přistání a 17 zachycení, což vedlo jednoho floridského sportovního publicistu, který přestupek nazval „Amadeeville Horror“. Defenzivní nářadí Trace Armstrong byl All-SEC v roce 1988, čímž vytvořil nový školní rekord v jedné sezóně v soubojích o ztrátu s devatenácti, včetně sedmi pytlů. V letech 1987 a 1988 byl pochozí bezpečnost Louis Oliver All-American.
